La Dirección Ejecutiva es la instancia superior del Mecanismo, responsable de su conducción técnica, estratégica y administrativa. Actúa con autonomía funcional, lidera la formulación y evaluación del plan de acción, y define directrices para la articulación institucional, territorial y temática. También mantiene coordinación con la entidad implementadora mediante mecanismos normativos y contractuales.